Антимикробные свойства прополиса экспериментально до последнего времени не были установлены. Правда, все, кто говорил о прополисе как об антисептическом или дезинфицирующем веществе в улье, фактически признавали его врагом микробов. На это указывает и отсутствие процессов гниения в замурованных в прополис трупах. В. П. Кивалкиной поставлены специальные опыты. Кусочки мяса различной величины (от 2 до 20 г) заключались в прополис и выдерживались в течение разных промежутков времени при комнатной температуре (16-18°) и при температуре термостата (36-37°). Затем запрополисированные кусочки мяса вскрывали и подвергали осмотру и микроскопическому и бактериологическому исследованию. Установлено, что прополис предотвращал развитие гнилостной микрофлоры.
Микробы постоянно попадают в улей через щели и отверстия соломенных матов или холстины. В момент сбора прополис загрязняется через инструмент и руки. Дальнейшее загрязнение или обсеменение его микробами происходит во время хранения через предметы окружающей среды и воздух. Находящиеся в воздухе микробы постоянно оседают. Если поместить прополис в условия, исключающие дальнейшее загрязнение его, и через некоторое время смывом с него сделать посев в питательные среды, то можно убедиться, что он становится свободным от микробов (среды остаются стерильными).
Следовательно, в прополисе как бы происходит своеобразный процесс самостерилизации, то есть освобождение его от попавших микробов.