В соответствии с наиболее распространенной гипотезой родиной медоносной пчелы является Индия. В качестве доказательства этой гипотезы приводится тот факт, что из четырех известных в настоящее время видов рода Apis в Индии имеется сейчас три вида: Apis dorsata, Apis florea и Apis indica. Однако возражением этой гипотезе является тот факт, что в Индии не существовало и не существует четвертого вида Apis mellifera, так же, как и в Европе не существовало первых трех видов. Правда, на том основании, что у Apis indica и Apis mellifera имеется много общего, было высказано предположение, что Apis mellifera является более молодым видом, отщепившимся от Apis indica, но такое предположение пока не имеет доказательств.
По другой гипотезе, должно было существовать два центра происхождения пчел: Индия и Передняя Азия, а может быть, только Передняя Азия. Однако поскольку систематика рода Apis разработана еще слабо, а пчелы Передней Азии изучены очень плохо, вопрос о правомерности этих двух гипотез остается открытым.
В конце третичной эпохи пчелы, населявшие Европу, должны были отступить на юг под влиянием надвигающихся ледников. Что же касается Закавказья, то оно является единственной территорией Европы, где сохранилась первобытная пчела, так как ледников там не было.
На вопрос о том, откуда началось обратное расселение пчел по территории Европы вслед за отступающим ледником, ответить пока трудно. Нельзя, например, предположить, что расселение пчел в Восточную Европу началось с Кавказа, потому что этому препятствовали образовавшиеся после ледника южнорусские степи. Остаются еще два варианта: либо пчелы проникли в Европу через Балканы, либо из Африки. Доказательством второго предположения могут служить следующие факты: во-первых, Африка соединялась с Европой в ту пору, и, во-вторых, по имеющимся в настоящее время данным, пчелы Северной Африки и Южной Франции имеют много общего в своих признаках, а пчелы Южной Франции мало чем отличаются от всех темных пчел Европы. В связи с этим возникает вопрос, каким образом пчелы попали в Крым: по Дунаю или с греческими колонистами.
Естественное расселение пчел на европейской части дошло только до Урала. За Урал и в Среднюю Азию пчелы были завезены сравнительно недавно, о чем говорится выше. Не было своих пчел и на Австралийском континенте вплоть до 1820 г., когда появилась острая необходимость в опылении садов. В Новую Зеландию пчелы попали с переселенцами в 1841 г.
В Америку медоносные пчелы впервые попали спустя столетие после открытия этого континента. До этого на американском континенте индейцы разводили безжалоносных пчел из подсемейства мелипоны. В США в 1636 г. европейцы завезли темных (голландских) пчел, в Южную Америку медоносные пчелы попали значительно позже — в 1845 г. из Португалии.